Русские видео

Сейчас в тренде

Иностранные видео


Скачать с ютуб Single-cell gene set activity with AUCell в хорошем качестве

Single-cell gene set activity with AUCell 2 года назад


Если кнопки скачивания не загрузились НАЖМИТЕ ЗДЕСЬ или обновите страницу
Если возникают проблемы со скачиванием, пожалуйста напишите в поддержку по адресу внизу страницы.
Спасибо за использование сервиса savevideohd.ru



Single-cell gene set activity with AUCell

How to use AUCell? Which of your cells are actively expressing a gene set? In R I use AUCell to label cells in a Seraut object which are enriched for user provided genes. This method is useful if you want to find which cells express a certain set of genes. These can be putative identity markers, response genes of some biological pathway, or any set of genes you are interested in. AUCell is a widely used and cited package. I also show you how to use the PangloaDB, which is an extremely useful database for cell identity markers in human and mouse single-cell data. Notebook: https://github.com/mousepixels/sanbom... 0:00 Intro 0:28 Collecting genes and data 1:44 Preparing genes and data 5:15 Running AUCell 11:16 Caveats

Comments