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O Curso de Oceanografia da UFSC tem 5 anos (ou 10 semestres) de duração. As disciplinas obrigatórias do curso são oferecidas nos períodos da manhã e de tarde. A admissão no curso ocorre anualmente através do Sistema de Seleção Unificado (SISU) e do Vestibular da UFSC em um total de 30 vagas. O curso tem o objetivo de formar profissionais com perfil multidisciplinar, capazes de compreender os diferentes processos físicos, químicos, biológicos e geológicos ocorrentes nos oceanos e seus ambientes transicionais costeiros. Nas fases mais adiantadas, a Oceanografia se divide em cinco áreas de profissionalização: Oceanografia Geológica, Oceanografia Biológica, Oceanografia Física, Oceanografia Química e a área Gestão e Educação Ambiental. O curso prevê a possibilidade de estágios de iniciação científica em diversos laboratórios de pesquisa de todas áreas da oceanografia. Também possibilita estágios não-obrigatórios junto a empresas.